Многофункциональные контроллеры Joy-Con предлагают игрокам новые возможности для развлечений. Каждый геймпад Joy-Con оснащен полным набором кнопок и может выступать в качестве самостоятельного джойстика. Каждый контроллер оснащен акселерометром, гироскопом, а также поддерживает функцию вибрации HD. Правый джойстик Joy-Con оснащён меткой NFC, что позволяет считывать или записать данные на amiibo. Набор включает в себя левый Joy-Con, правый Joy-Con и два ремешка Joy-Con.